A história acompanha os relatos do Doutor Simon Reddin sobre diversas experiências humanas ao redor do mundo durante as últimas décadas, tudo para criar seres superiores a humanidade. Aos poucos, estes superseres vão se descobrindo como deuses e começam a entrar em rota de colisão, em um conflito que irá moldar o futuro da Terra para sempre. Em Superdeus, Ellis aborda uma faceta que poucas histórias de Super-Heróis chegam a tocar: a ligação entre entidades superpoderosas dos quadrinhos com a parte da natureza humana que impele a adoração a divindades. Tudo isso junto com o conhecimento científico, místico e tecnológico que são marcas registradas do autor, unindo-se ao ilustrador Garrie Gastonny para criar este mundo caótico onde somem as barreiras entre Supers e Deuses.